花卉行业的产业化程度较低
1.规模化生产程度低
近些年，花卉的产销情况一直处于稳步上升阶段，但数量上的增加只是发展的一个方面。和其他行业相比，花卉行业的经营主要集中在中小企业和个体花农中，还没有形成一个产业链。大多数的小规模企业和花农只是凭借着多年的栽培经验进行花卉生产，同时由于设施不齐备，受气候的影响较大，高投入低产出的情况较多。分散的小规模生产造成了小生产与大市场的矛盾，难以形成规模效益。
近年来，花卉种植、销售的稳步发展使我们看到了花卉产业光明的未来，但花卉产业不单包括这两方面，花卉行业中的其它组成部分其实更是大有可为。企业对于新品种、盆器、生产设备、销售包装、养护产品所需的材料、工具等的开发，在企业获利的同时，可以完善从研发、生产、销售到售后服务一系列的花卉相关产业的发展，摆脱我国花卉业发展对国外的依赖，促进中国花卉业的整体提升。
2.缺乏行业标准
我国还没有启动花卉质量管理体系，多数花卉种植者还没有达标的意识，管理部门没有贯标的措施。在生产中，缺乏技术规程；流通中，对储存、包装、运输等没有严格的技术要求；交易中，没有市场准入制度。企业不掌握、不熟悉质量等级情况、检测技术和测试指标，在对外贸易时只能听从进口国(商)的操纵，经常遭到无理退货或压级压价，造成重大的经济损失。
3.科技水平较低、科技力量薄弱
花卉的种植曾经被认为是一个靠天吃饭的行业，和其他作物的种植没有区别。虽然它属于农业范畴，但要实现利益最大化，绝不足一块肥沃的土地、简陋的温室和一群有经验的花农就可以实现的，这是一种科技含量很高的产业。如果能够实现流水线生产，就可以节省人力物力，在产量大增的情况下实现标准化生产。2009年春天，围内的八个省市遭遇了重度干旱，种植花卉所需的水资源极度缺乏。如果在生产中应用潮汐式灌溉或滴灌技术，就可以使耗水量大大减少，这也方便了湿度的调控，将病虫害侵袭的危险降到了最低。
“科技兴花”是花卉产业发展的必由之路。世界花卉生产与贸易之间的竞争，实质上是科技水平与人才的较量。大多数从业人员没有经过专业培训，对新品种、新技术的了解和应用能力较差。而在花卉业发达国家，不仅从业者普遍受过中等专业教育，受过高等教育的人员所占的比例也较高。花卉人才匮乏的问题直接影响到花卉产业的发展。
另外，现阶段我国花卉研究转化率低。新品种、新技术是花卉产业发展的基础，新的科研成果能否迅速转化为生产力直接影响着花卉产业的发展。一些新产品、新技术的开发和研究多集中于高等院校和科研院所，与实际生产应用还有一定的距离。缺乏对新产品开发的投入，长此以往中国花卉产业就会没有自己的产品，没有自己的特色，成为无根产业，更谈不上今后的繁荣发展，也不符合国家提倡的可持续发展战略。
对花卉资源的利用方式不佳
我国是世界花卉种质资源宝库之一，但每逢节假日装点城市的国产花卉品种屈指可数，一串红、三色堇、矮牵牛、万寿菊等几种花卉用遍大江南北，淡化了城市的个性。而一些国外城市如伦敦、华盛顿、巴黎、东京等地，则分别配置应用着1500－3000种观赏植物。
相比之下，我国对于资源的合理利用就逊色了许多。开发量少不仅影响了城市景观，更或多或少地挫败了科研工作者培育新品种的信心。许多珍贵的花卉种质资源很容易就被外人通过各种方式“盗走”，成为他人的育种材料，育出的新品种再返销回来。玫瑰花就是一个很好的例子。玫瑰花由欧洲植物学家在18世纪育种成功。而培育这些品种所用的15个原种中，有10个原产中国。由于现代月季对环境的适应性更好，如今我国产销所需的玫瑰切花、种苗等均须进口，使“玫瑰之乡”的美名拱手让人，令人遗憾。
地域之间发展不平衡
改革开放30年来，我国花卉业区域布局明显优化。我国基本形成了以广东、云南、辽宁、四川和江苏为主的切花生产区域；以江苏、河南、浙江、山东、湖南为主的观赏苗木生产区域；以四川、广东、福建、浙江、湖南为主的盆景生产区域。一些我国特有的传统花卉产区和产品，如洛阳、菏泽的牡丹，大理、金华的茶花，漳州的水仙花，鄢陵的蜡梅等，得到了进一步巩固和发展。
各地找到自己在花卉产业中的产品定位固然重要，但再次审视这些产销情况排名前列的省市，我们发现南方城市明显多于北方，东部发展明显好于西部，特色花卉产区数目屈指可数并且长年没有增加。国内花卉产业发展主要受气候资源、地理位置以及能源与劳动力成本的影响，在激烈竞争中，有的地区花卉业已经成为支柱产业，但有的地区发展较慢，出现了地域之间发展极不平衡的现象。但每个地区都有适宜本地区生长的乡土植物，将其开发为不同规格不同花色的系列商品，做到人无我有、人有我精，提高本土花卉的市场竞争力，扩大生产规模销往其他地区，不仅可以降低管理和维护成本，还可以让更多的人通过植物认识一个企业、甚至一个城市，建立又一张“城市名片”。
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